​Ces travaux montrent que la méthode développée permet de faire le lien entre la biologie fonctionnelle et la biologie structurale chez les plantes, en rendant possible l'exploration systématique des réseaux de protéines dans des conditions proches de l'état physiologique. Cette approche offre un cadre méthodologique transférable à d'autres systèmes membranaires, souvent difficiles à étudier, ouvrant la voie à la modélisation de nouveaux complexes protéiques fonctionnels.

​Thylakoïdes* : structures membranaires situées à l'intérieur des chloroplastes, organites des cellules végétales (et des algues) responsables de la photosynthèse. Les premières étapes de la photosynthèse (capture de la lumière et sa transformation en énergie chimique) se déroulent au niveau de ces membranes.

Approches de protéomique* : techniques d'analyse permettant d'identifier et de quantifier les protéines d'une cellule, de fluides biologiques ou tout autre échantillon comprenant des protéines.

Cross-linking (XL)* : technique basée sur l'utilisation d'un réactif chimique capable de créer une liaison covalente entre deux protéines suffisamment proches dans l'espace. Cette approche permet de figer leurs interactions afin de pouvoir les caractériser et mieux comprendre comment ces protéines s'organisent et fonctionnent ensemble.

Spectrométrie de masse (MS)* : technique d'analyse qui permet d'identifier et de quantifier les protéines. Couplée au cross-linking (XL-MS pour Cross-Linking Mass Spectrometry), elle permet de détecter les protéines reliées chimiquement entre elles et de reconstruire l'organisation du réseau protéique au sein d'un système biologique.

PhoX* : réactif de cross-linking portant une charge négative, ce qui peut limiter son accès aux surfaces membranaires également chargées négativement, comme celles des thylakoïdes. L'ajout de TMPAC*, un composé chargé positivement, permet de réduire ces répulsions électrostatiques et d'améliorer l'accessibilité de PhoX aux protéines membranaires, tout en préservant l'intégrité structurale et l'activité biologique des membranes.

​Frances N., Giustini C., Finazzi G., Ferro M., et Albanese P. 

Deciphering photosynthetic protein networks: a crosslinking-MS strategy for studying functional thylakoid membranes.

The Plant Journal, 2026.